内蒙古大学考研左永春教授在蛋白质生物信息学研讨领域有新发展…(内蒙古大学考研公平吗)

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迩来，我校左永春教授团队在蛋白质序列、规划和功用分析的生物信息学领域获得最新科研作用，以“raacfold: a webserver for 3d visualization and analysis of protein structure by using reduced amino acid alphabets”为题，宣告在世界出论理学术期刊nucleic acids research（影响因子16.971）。nucleic acids research杂志由世界闻名出书商oxford university press出书，重视触及核酸代谢和彼此作用中触及的核酸和蛋白质的物理、化学、生化和生物学方面的研讨，在世界核酸/蛋白质及生物信息学研讨领域具有声威影响力。 蛋白质是细胞及整个生物体的遗传特性的直接体现者。蛋白质规划人工智能(ai)猜测东西alphafold的发布处置了生物学领域50年来的严峻科学应战，被两院院士评为2021年度世界十大科技发展之一，被science杂志列为2021世界十大科学打破第一。ai东西大大加马上人类安康监测、精准医学及新药研发进程，也为草原家畜等大动物的蛋白质规划猜测和功用解析研讨供给了新的前沿技能。相关于其它生物大分子，蛋白质分析具有更大的凌乱性，关于核算生物学家来说，这常常会影响核算功率，添加信息冗余与过度拟合的机缘。关于实验生物学家来说，这一般会影响蛋白质功用的说明、彼此作用和生物学注实寥。为了最小化上述坏处的影响，理论上可以将具有类似生化性质和频率分布的20种天然氨基酸构成的字母表紧缩为由更少氨基酸品种构成的约化氨基酸字母表，进而简化蛋白质序列和规划分析，这促进咱们根据该理论研宣告蛋白质分析平台raacfold。 论文宣告截图

raacfold使用 58 种约化办法?惴ɑ袢〉?687 个约化氨基酸字母表，研宣告三种分析东西：proteinanalysis、alignanalysis和multianalysis。proteinanalysis和alignanalysis供给具有类似特性和简化特征的序列和规划，有助于更清楚地辨认涣散在蛋白质规划中的功用区域，以获取要害特征信息。进而简化人工蛋白的方案，避免冗余信息。此外，multianalysis答应用户探究蛋白质规划和功用进化中的生物物理变异和保存性，进而为辨认和探究旁系同源物的非同源功用供给了重要信息。在raacfold交互界面中，撑持用户对序列、规划、功用注释的实时修改，烘托和导出。该平台供给四种视图方法：天然编码方法、约化编码方法、进化保存度方法、猜测可信度方法。为了创建直观的蛋白质规划视觉作用，raacfold供给健壮的 2d

和 3d 烘托功能，撑持阴影、归纳、粗糙度等细节烘托参数调度。一起撑持不一样的蛋白质规划闪现层面，包括表面和体积（分子表面、高斯体积等）、二级规划（卡通、带状等）和原子（球棒、空间填充等）。

raacfold的图形摘要

raacfold极好地处置了ai处置蛋白质序列、规划和功用分析中存在的特征维度高和冗余性疑问，鄙人降蛋白质凌乱性和捕获躲藏在噪声信号中的保存特征方面体现优良。关于核算和实验生物学家来说，它有可以变成蛋白质分析的一个重要构成有些，包括同源性检测、进化推理和功用猜测。经过该平台可认为蛋白质作用机制等研讨供给前瞻性理论，为发育进化等方面研讨供给有力的辅导作用，为蛋白质方案供给高效的分析平台。在该作用宣告之前，左永春教授课题组已建立了蛋白质序列氨基酸约化分析与特征获取平台psekraac （bioinformatics. 2021; esi 1% 全球高被引论文）、蛋白质氨基酸约化数据库raacbook （database, 2021; 软著挂号号2021sr0467812）、蛋白质序列功用域的可视化分析平台raaclogo（briefings in bioinformatics. 2021; esi 1% 全球高被引论文）。

左永春教授科研团队

通讯作者简介：左永春，教授，博士生导师，2011年结业于内蒙古大学物理科学与技能学院，获生物物理学理学博士学位，研讨方向为生物信息学。担任我国细胞生物学学会专委会委员，我国核算机学会专委会通讯委员，内蒙古生物物理与生物信息学会副秘书长等，世界current gene therapy期刊editorial board member和frontiers出书社的topics guest editor。以通讯或第一作者身份在nucleic acids research, cellular and molecular life sciences, briefings in bioinformatics, bioinformatics等世界出名期刊上宣告论文70余篇，被美国科学院院士等世界同行在nature和pnas等期刊累计引证次数1900多次(谷歌, h指数：27)，6篇论文先后当选esi 1%全球高被引论文，获得国家创造专利和软件作品权10多项。掌管国家天然科学基金面上项目等5项，内蒙古自治区超卓青年基金、高级学校青年科技英才、要害技能攻关等项目，先后当选内蒙古及其翻滚撑持，新世纪“321人才工程”及翻滚名单等。
该作业由我校生命科学学院、省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家要点实验室与内蒙古科技大学协作。内蒙古大学是该论文第一作者单位和第一通讯作者单位，论文第一作者为2021级博士生郑磊，左永春教授为第一通讯作者，内蒙古科技大学生命科学与技能学院邢永强教授为一起通讯作者。该研讨还得到国家天然科学基金（62061034, 62171241, 61861036, 62161039）、内蒙古天然科学基金超卓青年培育基金（2021jq04）、内蒙古要害技能攻关项目（2021gg0398）以及内蒙古青年科技英才（njyt-18-b01）等项意图撑持。

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